【第331回】 東京での会議が中止になったので名谷で仕事（2020年3月6日）

• 6:30起床。レトルトカレーとレトルトご飯とほうれん草と生卵で朝食を済ませ，査読の続き。
• Bi Q et al. "Epidemiology and Transmission of COVID-19 in Shenzhen China: Analysis of 391 cases and 1,286 of their close contacts"（2020年3月4日）は，1月14日から2月12日まで深圳CDCが患者391人から1286の濃厚接触を追跡して得られたデータの分析から，R＝0.4で局所封じ込めに成功したということと，家庭での大人から大人への感染と大人から子供への感染は同じ程度ということを報告している論文だが，この結果から学校閉鎖が有効な介入になることをサポートするかもしれないなんて言ってしまうのは早とちりで，これ家庭内での感染の話だから，子供たち自身が感染を広めているかどうかなんて見てないし，症状が弱かったら感染力も弱いと考える方が自然と諫めるコメントがつくのは健全。後のコメントをした人は疫学のプロでOne Healthを研究している方。最初のコメントをした人もJohn Hopkinsのヘルスセキュリティの講師で，素人ではないはずなんだが。川端君の『エピデミック』にも出てくるが，疫学的推論においては，常にロジックの強度に意識的であることが非常に重要。
• JAMAから2つリンクしておく。Young EB et al. "Epidemiologic Features and Clinical Course of Patients Infected With SARS-CoV-2 in Singapore"（2020年3月3日，無料でダウンロードできるが，いつの間にか，JAMAは個人アカウントを作ってログインしなくてはいけなくなったようだ）は原著論文で，シンガポールのSARS-CoV-2感染者の疫学的特徴と臨床経過について報告している。Ong SWX et al. "Air, Surface Environmental, and Personal Protective Equipment Contamination by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) From a Symptomatic Patient"（2020年3月4日）はresearch letter（注：短報のようなもので，一般に原著論文より査読の壁が低いことが多い）で，症状のある患者からのSARS-CoV-2による空気，環境中の物の表面，個人防護用具(PPE)の汚染，というタイトル。シンガポールのデータで，患者3人（で症状の程度も2人が中等度，1人が軽症）だがウイルス排出量に大きなばらつきがあること，空気サンプルはすべて陰性だったこと（排気口は陽性），PPEの汚染は靴表面から1サンプルだけだったこと，などを報告している。サンプルサイズが小さいのであまり情報量はないが（AFPBBが報じているトイレの汚染も1例だし），既報と矛盾はしない。
• 東京で予定されていた会議が中止になったので，今日も名谷キャンパスへ自主的時差出勤。こういうとき完全フレックスだと楽で良い。
• 昨日触れた入国拒否は専門家会議は何も聞いていない話だったと東京新聞が報じている。対策本部に出てきた昨日の国家安全保障会議からの資料２が中国・韓国・イランからの渡航制限の内容と思われる。これも現在の流行状況で有効であるという科学的根拠はない。しかも，国籍による差別を含んでいる（宿主の国籍はウイルス感染とは明らかに無関係）。もちろん，一般に人口移動を制限する方が，しないより感染症の伝播を下げることは，定性的には明らかだ。しかし，どれくらい効果があるのか，デメリットはどれくらいあるのかの見積もりもせず，国家安全保障の観点から政治的に判断というのは，とても危うい（日本だけでなく，複数の国がこれをやっているのは，もっと危うい。昨日，世界が混沌としてきた，と書いたのはそういう意味だ）。例えば，中国が1月に武漢市を封鎖したように，国内でクラスターが発生している地域とそれ以外の人口移動を制限する方が，感染拡大の抑制には明らかに有益だろう。もっと極端な話をすれば，新興感染症の患者が1例見つかった場合，仮にワクチンが存在したなら，リングワクチネーションという方法があり，患者周辺の10万人にワクチンを打てばRt＜1となって封じ込めできる可能性が高いが，ワクチンがなくても患者周辺の10万人を封鎖してしまえば，そこから外には感染は広まらないことになる（ワクチンの場合と違って，封鎖圏域内は見捨てることになるが）。しかしCOVID-19は不顕性感染も軽症で診断されないままの人も多いため，陽性の人が1例見つかった時点で既に10万人圏域より外に感染が広がっている可能性があるから，こういう形での封じ込めが成功する可能性は低いし，武漢市封鎖のようなやり方は（中国はSARS流行時も街ごと封鎖というのをやっているが），CFRが2％とか3％の病気では，他の国では人道上無理だろう。市中感染がある程度発生している状況で打つ政策ではないと思う（市中感染発生より前か，クラスター対策が成功して封じ込めに成功する見込みが出てきた後なら，まだ検討の余地はある）。2月1日から流行地からの入国については個別に閣議決定で指定して制限を掛けてきたわけだし。これも単なる首相の「やってる感」アピールだろう。しかもレイシスト的支持者層向けなのが救われない。
• 先日プレプリントサーバに載っているのを紹介した，"An R package and a website with real-time data on the COVID-19 coronavirus outbreak"というタイトルの論文だが，3月5日付けで更新版がアップロードされていた。前のバージョンでは，COVID-19の公開データへのアクセスを容易にするためのRパッケージを開発したという論文だったが，更新版では，それを可視化したり予測をするウェブアプリも開発したと報告されていた。
• 東日本大震災が起こった2011年3月11日から9年目の日，NHKニュース7がのんさんをスタジオゲストに呼ぶとのこと。クロ現プラスやNスペもそうだが，NHKにはまだ良心が残っているのだなあ，と思う。
• クロロキンについてAntiviral ResearchというジャーナルにOf chloroquine and COVID-19（2020年3月5日掲載）というコメンタリーが出たが，とくに新しい情報はなかった。ぼくと同じ認識。2月上旬から中国では治験が始まっているのに，まだ信用できるデータが出てこないのは遅い気がするので，やはりネガティブだったのか？
• 真面目に読んで山ほどコメントしたのだが，もう一人の査読者があっさりリジェクトしていたときの脱力感。国内学会誌のような配慮は要らなかったな。
• 全学的に年々シラバスに書く内容が形式的にだけ厳しくなっていくのは，文科省の圧力なんだろうが，無意味だと思う。反論できないのだろうか。修論や博論まで単位化されているからといって15回×2の計画なんて書けるはずがない。が，中間管理者を困らせてもいけないので，とりあえず要求には応じるしかないか。一律要求ならば，事務的にというか機械的にコピペしてくれたら良いのではないかとも思うが。
• ドラゴンズとイーグルスのオープン戦は1-3で負け。やはり則本投手レベルが来ると簡単には打てないか。
• 1件だけ応答できていないメールがあるが，20:30を過ぎてしまったし，空腹でもあるので帰途に就く。

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