【第744回】 オンライン会議とか（2021年5月21日）

• 7:00起床。81.30 kg，97％，36.1℃。
• 今日は2限にオンライン会議。後は某大会準備と来週の講義準備。雨が酷いので在宅勤務にしたいところだが，出勤しないとできないことがあるので名谷キャンパスへ向かう。
• 最近のいくつかの講義のため，これまでちゃんとフォローしてこなかった変異株とワクチンの記述をまとめたので（網羅的ではないし深くもないが，基本的なところだけ），ここにも載せておく。

  変異株について

  ■RNAウイルスなので突然変異を起こしやすい。HIVよりは遅い

  ■1つ以上の変異によって感染力や病原性が変わったウイルスをvariant（変異ウイルス，変異株）と呼んでいる

  ■マスメディアでイギリス株とかインド株とか呼ばれているのは，その変異株が最初に報告された国だが，差別や偏見を助長する恐れがあるので望ましくなく，厚生労働省の資料などでは「英国で確認された変異株（VOC-202012/01）」のような書き方がされている。

  ■CDCは変異株を3つのクラスに分けていて，2021年5月7日現在該当する変異株は以下（その後WHOや日本はB.1.617系統もVOCに指定したが，2021年5月21日現在，CDCの分類ではまだVOIのままである）。

  • VOI（注目すべき変異株） B.1.526 (20C/S:484K), B.1.526.1 (20C), B.1.525 (20A/S:484K), P.2 (20J), B.1.617 (20A), B.1.617.1 (20A/S:154K), B.1.617.2 (20A/S:478K), B.1.617.3 (20A)
  • VOC（懸念される変異株） B.1.1.7 (20I/501Y.V1), P.1 (20J/501Y.V3), B.1.351 (20H/501.V2), B.1.427 (20C/S:452R), B.1.429 (20C/S:452R)
  • VOHC（重大な結果をもたらす変異株）まだ該当無し

  ■例えばN501Yはスパイクタンパク上で変異したアミノ酸とその位置なので変異名。各変異株は複数の変異を含むことがある。

  ■変異株名としてはPango lineagesによるB.1.1.7やP.2のような命名とNextstrainによる20Cのような命名があるが，VOC-202012/01のような表記もある（VOC-202012/01とB.1.1.7と20I/501Y.V1は同じもの。いわゆる英国変異株）。501Y.V2（いわゆる南アフリカ変異株）や501Y.V3（いわゆるブラジル変異株）はN501Y変異とE484K変異を含む。B.1.617, B.1.617.1, B.1.617.2, B.1.617.3（いわゆるインド変異株）はL452R変異を含む。

  ■N501Y変異をもつと感染力が強く，E484K変異をもつと中和抗体の有効性が低くなる報告がある。

  情報源

  (CDC) https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html

  (WHO) https://www.who.int/csr/don/31-december-2020-sars-cov2-variants/en/

  (JAMA) 2021年2月9日のViewpoint "Genetic Variants of SARS-CoV-2-What Do They Mean?" https://doi.org/10.1001/jama.2020.27124

  (NEJM) 2020年12月31日のClinical implications of basic research "Emergence of a Highly Fit SARS-CoV-2 Variant" https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMcibr2032888

  (Vaccines) 2021年3月11日の論文 "Emerging SARS-CoV-2 Variants and Impact in Global Vaccination Programs against SARS-CoV-2/COVID-19" https://dx.doi.org/10.3390%2Fvaccines9030243

  （厚生労働省）2021年4月26日付け資料４「新型コロナウイルス感染症（変異株）への対応」 https://www.mhlw.go.jp/content/10900000/000774322.pdf

  
  

  ワクチンは出口戦略になるか？

  ■NZや台湾は排除(Elimination)戦略をとり，かなり厳格な水際対策（重要！）をとると同時に，感染者が増え始めた時点でロックダウンなどの強い行動制限と接触追跡，検査，隔離を徹底して新規感染者ゼロが数日続いてから制限解除とすることで，長期間にわたって国内感染ゼロ状態を維持している→その状態なら行動制約不要。ワクチン接種を急ぐ必要もない

  ■ロックダウンを繰り返しても十分に抑え込めず蔓延した欧米諸国では，想定されていた中では最速で有効なワクチンが開発されたことから，ワクチン接種が進んでいる。

  ■国内で接種承認申請されたのは2021年5月8日現在，以下３つ[https://www.mhlw.go.jp/content/10906000/000707431.pdf]。PMDA承認済はファイザーのみ（追記：2021年5月21日にモデルナとアストラゼネカも特例承認された。ただし，アストラゼネカのものは，5月21日現在，薬事承認はされたが予防接種法に基づく接種には使えない）。

  • ファイザー： mRNAワクチンで約95％の発症予防効果。おそらくPEGのアレルギーの報告あり（日本アレルギー学会報告，https://www.jsaweb.jp/modules/news_topics/index.php?content_id=546）。長期保存はディープフリーザー要。普通の冷凍だと最長２週間有効，その後冷蔵で解凍なら５日以内に希釈，常温で解凍なら2時間以内に希釈し，６時間以内に使用。2021年2月14日承認。
  • モデルナ： mRNAワクチンで約95％の発症予防効果。－20℃冷凍でOK。PEGの問題はありそう。2021年5月21日特例承認。
  • アストラゼネカ： ウイルスベクターワクチン。Oxford Univとの共同開発なのでUKでは多用。発症予防効果は70-80％程度。血栓形成しやすいという報告があり，EU諸国で一時使用停止になった。冷蔵で6ヶ月有効なのが利点。2021年5月21日特例承認。

  （厚労省） https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/vaccine_00184.html: 国産ワクチン開発は塩野義製薬，第一三共，アンジェス，KMバイオロジクスなどが取り組んでいるが2021年3月現在，どれも臨床試験中。実用化は2022年以降。

  ■ワクチン接種はイスラエル，英国などでは効果があったがチリでは奏功せず（BBCなどメディアが批判，BMJのNewsは，1回目接種の後対人接触が増えたせいと論じている。

  ■日本のようにワクチン確保が遅れた国や，冷蔵・冷凍運搬システムなどのインフラが未整備な途上国ではどうするか（財力の無い国にも公平に行き渡るようにCOVAXファシリティ[https://www.mhlw.go.jp/content/10900000/000747950.pdf]という仕組みが作られ，日本も多額の出資をしているが，ワクチン確保には明らかに国間で差がある）

  ■ワクチンの効果が落ちるかもしれない変異株（いわゆるブラジル株，インド株など）が出現したが大丈夫か？

• 来週の講義資料を作ってアップロードし，Zoomの予約をしてBEEFを更新してから帰途に就いた。
• このtweetから始まるスレッドが面白い。R-4.0.5以前はパイプ処理したい人はtidyverseというかdplyrというかHadley Wickham師の構築した世界で%>%を使ってきたわけだが，R-4.1.0で本体に|>が実装されたので，さてどうなる？　という。
• 20:00から川端君のオンライン茶話会第4弾に参加。1時間半近い講演と1時間の質疑応答，お疲れ様でした。講演中に紹介されたColour Vision Screenerのような21世紀的な新しい方法で定量性のある色覚検査ができたとしても，有効な治療法がないなら，スクリーニング実施基準を満たさないので，スクリーニングはなされるべきではない。ましてや確定診断にはアノマロスコープを使うべきという指針が有名無実で，確定診断にも同じ石原表が使われてきたという現実からすると，2002年に廃止されるまで長年にわたって行われてきた学校健診でのスクリーニングは誤りであった（廃止されて良かったと思っていたが，ほとんど意味が無いと言うことで座高測定や蟯虫検査を廃止した2014年の文科省からの通知で，色覚について個別検査を受けられる体制を作るようにと書かれていて，同意をとって健診項目に入れる学校もでてきているようだ）。講演中，コンサイス版の基準が見つからなかったという話だったが，2014年の文科省通知を受けて（？）日本眼科医会が出した指針には14表のうち12表だけ使って検査し，2表以上の誤読で色覚異常疑いとして眼科受診を勧めるよう書かれていた。しかしこの「指針」は，それが遺伝的スクリーニングになりかねない面への配慮がなく，コンサルテーションの必要性も明記されていないし，「将来を担う児童生徒が色覚の特性のため学習や進路就職等にて不利益を受けないように眼科学校医をはじめ眼科医はしっかりと対応する責務があると思われる」という結語を，職業制限を所与の物として警告すべしという意味に受け取った学校医や眼科医が，かつてあった差別を拡大する危険さえある。例えば聴力は，治療ができないものであっても補聴器を使うことで聞こえを良くすることができる場合が多いし，視力も，治療ができないものであっても眼鏡やコンタクトレンズを使うことで改善が可能なので，年齢に閾値があると言われる言語能力や形態認識能力の発達にとって必要というロジックで，三歳児健診というスクリーニング的な場での実施が正当化されるけれども，色覚にはそのような技術がないので，スクリーニングして検出しても，コンサルテーション以外には当事者にとってのメリットがない。コンサルテーション体制が不十分なままに実質的にスクリーニングに近い状況が既成事実化していっているとしたら，大変まずいことだと思う。人類の文明は多様な「弱者」が不都合を感じずに暮らせるように技術を開発して社会基盤整備を進めてきたわけだし，社会の側が個別の「弱者」を炙り出さなくても，誰もがありのままで不都合なく暮らせるのがユニバーサルデザインの思想なので，色覚についてもCUDを進めるのが望ましい社会のあり方だと思うし，RがR-4.0.0以降，palette("Okabe-Ito")とするだけで標準色パレットをCUDに切り替えられるようになったなど，少しずつ技術は進んでいると思うので，決して悲観はしていないが。
• ドラゴンズは勝ち越すチャンスがたくさんあったが，結局1-1で引き分け。大野投手が良いピッチングをしていたので，勝ちたかった試合だが残念。

Tweet(list)

▼前【743】（今日は5限も含めて丸一日講義（2021年5月20日） ）　▲次【745】（川端裕人『空よりも遠く、のびやかに』読了（2021年5月22日） ）　●Top

Notice to cite or link here | [TOP PAGE]