【第840回】 メールに返事をしながら成績評価完了し査読作業（2021年9月6-8日）

• 6:00起床。朝食を済ませてからレポート採点を続け，夕方になって漸く完了。9:30頃からリフォーム作業の業者が来て時折対応しながら。洗面所も台所も使えないので生活しづらいが仕方が無い。
• これから査読作業。メールの返事をしながらやっていたが，日付が変わる頃疲れたので眠った。
• 火曜は6:30起床。今日も時折リフォーム対応とメール返信しながら査読作業。
• 数日ぶりにグラフを描いてみた。
• 高橋将宜さんがWonderful Rの第5巻として出版予定の本は大変興味深く役に立ちそうな内容。買わねば。高橋さんのtweetからすると，Wonderful Rシリーズは査読があるんだな。扱われるテーマが広いので，もし石田さんが全部査読しているなら大変だろうと思うが，まあ普通に考えたら，巻ごとに近い分野の人に振っているんだろうなあ。
• 今日のドラゴンズの試合はなかったことにしたい。7-3で勝っていて9回裏にライデル・マルティネス投手が登板したのに5点取られてサヨナラ負けなんて信じられない。
• 水曜も6:30起床。朝食を済ませてから査読の続き。今日は8:20頃から設備屋さんが到着して作業開始。トイレが暫く使えなくなるとのこと。
• シンガポールといえばCFRが世界の中でも例外的に低いことで知られている。たぶんほぼ完璧に接触者追跡ができていてCFRがIFRにきわめて近いためだろうと思うが，ワクチン接種率が80％に達したことから，8月30日からいろいろな行動制限を緩和するという発表が8月19日になされていた。ところが感染者が急増してしまったため，迅速抗原検査キットを9月中に全世帯に配布し，免疫不全の人と高齢者等にブースター接種をするという発表が9月3日になされ，9月13日から義務的な検査の頻度を2週間ごとから毎週に上げ，対象もケアサービス従事者やジム・フィットネススタジオ勤務者から，小売店モールやスーパーや配送業などの従事者やタクシー運転手に拡大し，他業種にも迅速抗原検査キットを配布し，今後2週間は不可欠でない社会接触を減らすことを強く奨励するという発表が9月6日に出た。デルタ株流行下では，80％がFully vaxedでも行動制限を緩めたら感染急拡大することが，このシンガポールの経験からも示された。イスラエル，UK，USAでわかっていたことだが（→追記：2021年9月16日に，田口善弘さんがtweetでご指摘くださった通り，これは不正確で，R0が5-9のデルタ株ではFully vaxedが80％でも集団免疫閾値に達しないことがほぼわかかっていたのはシミュレーションを含む数理モデルからであって，これらの国はワクチン接種は80％よりは低い時点で制限緩和したので，シンガポール政府は80％なら大丈夫だろうと期待して制限緩和したのだろうが，やはりダメだった，というのが正確です）。ただ，シンガポールはスマホアプリのTraceTogetherを去年春から実用化しているだけでなく，スマホをもっていない高齢者や子どもでも使えるTOKEN GO WHEREを配布するなどのデジタルトレーシング手法も活用して追跡と隔離をちゃんと続けているので，イスラエル，UK，USAほどの感染拡大にはならないと思う。
• 昨日からのTweetsを拾っておく。水野さんのワクチン接種率ごとのRt＜1に必要な自粛率のグラフに対して，pはワクチン接種率ではなく接種率と感染予防の有効性の積になるはずとコメントしたところ，有効性を90％と仮定した修正グラフを作ってくださったので，90％は少し高すぎる点と異質性議論について余計なことをコメントしてしまったところ，(1)西浦さんから異質性についてツッコミが入ったので，元からこの文脈で触れるべきではなかったと応答し，(2)水野さんから90％が何故高すぎるのかとご質問いただいたので，発症予防なら90％でも良いが，いくつかの文献を見るとデルタ株に対する感染予防の有効性は60％くらいではないかとご返事した（参照した文献は，Harder T et al. "Efficacy and effectiveness of COVID-19 vaccines against SARS-CoV-2 infection: interim results of a living systematic review, 1 January to 14 May 2021"という2021年7月15日のEurosurveillanceに載っていたシステマティックレビューとFowlkes A, Gaglani M, Groover K, et al. Effectiveness of COVID-19 Vaccines in Preventing SARS-CoV-2 Infection Among Frontline Workers Before and During B.1.617.2 (Delta) Variant Predominance — Eight U.S. Locations, December 2020–August 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2021;70:1167-1169.）。
• Fully vaxedの人でも鼻腔感染はするという実験的研究が出たという日経/ナショジオの記事があったが，ソースがプレプリントでmedrxivに載っていると書いておきながら当該論文へのリンクがなくdoiも書かれていないのが惜しい。当該論文を読むと，デルタ株が優占しているウィスコンシン州で，自己申告を接種登録で確認した（うち33人は自己申告では未接種だったのに接種登録があったが）ワクチン未接種の人と2回接種終了後2週間以上経った人から得たスワブ試料を採取してウイルス排出量を比較したところ，Ct値が25未満という感染力のある量のウイルスが検出された割合もCt値の分布も，2群間で統計的に有意な差が無かったとのこと。
• 13:30頃に査読が1つ終わって，次の査読に突入。もう1つ，比較的短時間でできそうな査読もあるのだが，入ってきた順に作業している。
• 現在トイレが撤去されていて，夕方には再設置されるはずなのだが若干不安。最悪の場合は近所の公園に行けば良いのだろうが。
• 15:00からオンラインで教員会議に出席予定。
• その後無事にトイレが再設置されて良かった。ただ，洗面台も台所も風呂場も使えないので，まだ水道は屋外の水栓に頼るしかないのが辛い。
• 18:00から国際保健の院生中間報告会，その後は院生の相談にZoomで対応したら21:00になっていて，ドラゴンズの試合はもう終わって，4-1で勝っていた。
• 晩飯を食べ終わったら22:00という。
• その後も少し査読作業をしていたが疲れたので日付が変わる頃に眠った。

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