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【第315回】 新年度オリエンテーション開始とR-3.0.0インストール(2013年4月4日)
- H7N9の情報源として,WHOのFAQと,ProMED-mailをリンクしておこう。
- 今日は学部2年から4年の新年度オリエンテーションがある。
- R-3.0.0は,兵庫教育大ミラーにはまだWindowsバイナリは入っていないが,CRANの本体では既にダウンロードできるようになっているので,たぶん今日中にミラーにも入るだろう。
- 9時過ぎにチェックしてみたら,R-3.0.0のWindows版バイナリは,兵庫教育大ミラーにはまだ入っていないが,統数研ミラーにはもう入ったので,インストールしてみる。
- Windows環境でのパッケージ開発に必要なRtoolsも,R-3.0.x用のRtools30.exeが公開されたのでインストールする。
- R本体とRtoolsのインストール後,Rを起動して常用パッケージをインストール。
- install.packages("pyramid")
- install.packages("fmsb")
- install.packages("Rcmdr",dep=TRUE)
- install.packages("RcmdrPlugin.EZR", dep=TRUE)
- install.packages("maptools", dep=TRUE)
- install.packages("XLConnect", dep=TRUE)
- library(Rcmdr)
- 問題なし。
- ツール>Rcmdrプラグインのロード>RcmdrPlugin.EZRを選びRcmdr再起動
- 問題なし。
- ファイル>データのインポート>テキストファイル等々のインポートからタブ区切りテキストを読み,グラフ>反復測定データの折れ線グラフ
- 問題なし。
- 以上,R-3.0.0と,ぼくが常用しているパッケージのWindows 7 Home x64での動作確認。とりあえず問題なし。次はWindows 7 Professional x64マシンで同じ操作をしてみる。
- werの新しく届いたコンピュータのセッティング。初回起動シークエンスの最後の段階をさせてから学部2年のオリエンテーションへ行ってきた。といっても,来週月曜から授業開始だし,あまり詳しく自己紹介はしなかった。2年生ってちょっと中弛みする人もいる時期なので,気合いを入れ直して頑張って欲しいとだけ伝えた。
- その後,werコンピュータのWindows Updateをさせつつメール送受信していたら昼になってしまった。
- werコンピュータのupdateと平行して,vaio-saにR-3.0.0とRtools30をインストールし,source("http://minato.sip21c.org/swtips/instmyusuallibs.R", encoding="UTF-8")で自分が常用しているパッケージのインストールを済ませた。後は環境変数とRStudioの設定とdk/wの関連づけ設定を書き換えればアップデート完了のはず。
- うーん,RStudioが,これまでのバージョンだと,R-3.0.0では動作しない。RStudioのバージョンアップを待つか。
- と思ったら,柏野さんがRStudioの最新版なら動作するという情報をくださったので,改めてRStudioの最新版をダウンロードしてインストールしたら無事に動作した。0.97だから最新版だと思っていたが,どうやらこれまで使っていたのは0.97.248で,最新は0.97.336だった。我ながら間抜けだった。ちなみに,R-3.0.0はR-2.15.3とは別ディレクトリにインストールされるので,もう不要な場合はR-2.15.3をアンインストールすることになるが,RtoolsとRStudioは上書きインストールされ,旧版のインストール情報も残らない。
- RAnalyticFlowは2.0でも2.0.1でも,起動しようとすると設定ウィンドウが出てきて,Rのインストールディレクトリを指定し直し,JavaJDパッケージのインストールを求めてくるのでOKすると,それだけで無事に動作した。
- 直通終バスで帰宅し,ベーコンとナスとピーマンのトマトソース炒めと,ワカメとキュウリとジャコの酢の物を作って晩飯。洗濯をして部屋干ししてから風呂を洗って湯を張ったのだが入る前に眠ってしまった。
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