【第929回】 今日も修論添削とか書類作りとか（2022年1月3日）

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• ファイザーは先月上旬にオミクロン株に対してもmRNAワクチン2回接種で誘導される細胞性免疫は有効，抗体による中和能は顕著に低くなっているが，3回目接種をすると中和抗体価が25倍になるという発表をしている。NEJMのEditorial（Patel MK "Booster Doses and Prioritizing Lives Saved"，2021年12月23日付けだが2021年12月8日掲載，以下同様）が，「本誌でブースター接種の有効性について必要とされていた証拠を提供する」と紹介している2つの原著論文が，Arbel R et al. "BNT162b2 Vaccine Booster and Mortality Due to Covid-19"とBar-On YM et al. "Protection against Covid-19 by BNT162b2 Booster across Age Groups"である。後者ではイスラエルのデータで，12日以上前にブースター接種を受けたグループの重症化リスクや死亡リスクを，最初の分析としてブースター接種を受けていないグループと比較し，二番目の分析として3-7日前にブースター接種を受けたグループと比較している。罹患率比を出しているのだが，単純に素データで出しているのではなく，ポアソン回帰を使って性別，年齢層，民族（demographic groupという用語で，一般ユダヤ人，アラブ人，厳格正当主義ユダヤ人[=ultraorthodox Jewish]の区分を指している），2回目接種を受けた日を共変量として，過去7日間の感染確定報告数に基づく居住地別曝露リスク指数を時間依存する共変量として調整して計算していて，全年齢層でブースター接種は重症化リスクや死亡リスクを下げるのに有効であることを示している。とはいえ，効果には年齢差があって，40-59歳では60歳以上よりも効果は小さくなっている。ちなみに，Table 3に載っている，ポアソン回帰で求めた率比は，12日以上前にブースター接種を受けたグループに対するブースター接種を受けていないグループの重症化率比は，60歳以上で17.9（95%CI: 15.1-21.2），40-59歳で21.7（95%CI: 10.6-44.2）となっているが，単純に観察人日当たりの重症化数の比を計算する率比では，library(fmsb); rateratio(977 ,166, 22135011, 46668795)とすると，60歳以上で12.4（95%CI: 10.5-14.6），rateratio(168, 8, 27599399, 25890717)とすると，40-59歳で19.7（95%CI: 9.7-40.0）なので，共変量に入れた変数の交絡によって差が薄められていることがわかる。同誌には2021年12月29日付けで2本のCorrespondenceも載っていた（"Third BNT162b2 Vaccination Neutralization of SARS-CoV-2 Omicron Infection"と"Effectiveness of BNT162b2 Vaccine against Omicron Variant in South Africa"）。
• 箱根駅伝を流しているが，青学強すぎ。9区と10区で区間新を出して，復路新記録と大会新記録の総合優勝で，2位に10分以上の大差をつけた。

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