【第1273回】 シャーロック・ホームズ（2016年3月24日）
- 6:30起床。昨夜作った具に茹でた生パスタを追加して朝食。鼻水が相変わらずなので，ルルアタックFXを飲んだ。
- 朝食を食べながら，何日か前に本屋で見掛けて衝動買いした「ケトル」のシャーロック・ホームズ特集号をパラパラめくっていたら，神戸在住シャーロッキアン（といえるほど深くはないが，小学6年生のときに初めて自分で買った文庫本は，新潮文庫の『シャーロック・ホームズの思い出』だったし，その後中学生の間に新潮文庫のドイル作品は全部買い揃えたし，パスティーシュ作品もかなり買い集めたくらいにはファン）としては見逃せない情報が載っていた。
- 神戸異人館の英国館にシャーロック・ホームズの部屋が再現されているというのだ。しかも，夜はバーになるという。ガソジーンというビクトリア朝ロンドンで炭酸水を作るのに使われていた器具があって，それを使ってホームズが飲んだことになっているウイスキー・ソーダを作って飲んでみたという。普通の客にガソジーンは使わせてくれないだろうが，同じ銘柄であるデュワーズを使ったウイスキー・ソーダくらいは飲ませてくれるのではないだろうか？ と想像は膨らむ。せっかく神戸にいるのだから，これは行かない手はないと思った。店長ブログへというリンクをクリックしてみたら，「ホームズのブログ」，タイトルからして本気のシャーロッキアンっぽいが，時々アイリンアドラーIII世という署名が入っていたので，もしかしたらケトルの記事に登場していた広報の崎原朝香さんが書かれているのかもしれない。
- 新聞やテレビの報道ではソースがわからず何とも考えようがなかった話だが，この記事のおかげで厚労省研究班の発表資料がわかった。件の記事は，最大のポイントである表現型頻度と遺伝子頻度を比較するのがナンセンスという指摘はまったく正しく重要だと思う。なぜ研究班の発表がそんな初歩的な勘違いをしたのか謎。最近の文献としてこれとかこれを参照すると，血縁関係の無い日本人健康対照群データではDPB1*0501の表現型頻度は65％程度のようだから，鹿児島大の表現型頻度を使って二項検定しても，Rでbinom.test(18, 21, 0.65)と打つとわかるが5％水準で有意な差はない。ただ，村中医師の記事は，統計学的に若干の誤解があると思う。サンプルサイズが小さいのだから有意水準を5％にするのはおかしくないし（だからオッズ比も95％信頼区間が与えられている），Bonferroni-Dunn's correctionは，同一遺伝子座についての比較回数を考慮した補正だから，この場合10ではないと思う（厚労省サイトの表が本当ならばDPB1は2つのアリルしか調べていないので2になるはず。しかし普通はもっと多くのアリルを調べると思うので，もっと多い可能性が高いと思う。けれども検定の多重性の調整は，どういう帰無仮説族を検定するかに依存するので，それが書かれていない限り何とも言えない）。また，中間解析するのは悪いことではないし，サンプルサイズが小さい段階で統計学的な有意差が出たのならそれは意味があることで，有意差が出なかったときには検出力が足りないだけかもしれないのでまだ差があるかないかわからないという解釈が普通だろう。アリル頻度を使って検定した場合，一般日本人集団のDPB1*0501頻度が0.384でも0.407でも（HLA研究所の実数が出ているデータを使わないとフィッシャーの検定はできないが，二項検定ならば割合だけでできる）確かに信州大データだとbinom.test(13, 28, 0.384)の結果はp=0.44程度で有意差はないが，鹿児島大データではbinom.test(24, 42, 0.407)の結果はp=0.04程度になり（なお，binom.test(24, 42, 0.384)ならばp=0.0165程度になり，松田教授がフィッシャーの検定で出した結果とほぼ同じ値になる），そのままでは5％水準で有意差があるといえることになる。ただしこの遺伝子座について2つのアリルを比較しているので2倍すると，差は統計学的に有意であるとはいえなくなる。その意味で，京都大学の松田教授の談話はまったく正しいが，村中医師の解釈には若干の誤解があると思われるのが残念。統計学的な批判をするのだから，統計学的な表現にはもっと気を遣った方が良いと思う。
- 直通終バスに乗るつもりだったが，50メートルくらい離れたところでバスのドアが閉まって発車するのを見送る羽目になったので，湊川公園廻りで21:20頃帰宅。タマネギとベーコンとナスとピーマンを刻んでコンソメスープで煮込みカレー粉を加えたスープカレーを作り，餅を1個電子レンジで加熱して加えたものを晩飯にした。
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