【第383回】 食材を買いに行かなくては（2020年5月2日）

• 6:30起床。76.20kg，98％，36.4℃。
• twitterで知ったが，コロンビア大学SPHのPopulation Health Methods: Techniquesは素晴らしい。基礎の一歩先くらいの分析方法がたくさん載っている。APCとかABMもあるし，空間疫学手法の解説が充実している。
• NHKで，三宮のライブハウスが合同で無観客有料ライブ配信を企画していたが，休業要請が出たので事前収録したものを無料配信したところ，6割のチケット購入者が返金を辞退したという話を報じていた。ライブハウスジャッジメントのことだろう。ああ，でも6月21日に振り替え公演はあるんだな。神戸デジタルラボが技術協力しているそうだ。
• 食材が尽きそうなので，昼前くらいに長田のLIFEまで買い物に行ってこよう。
• 昨日はスキャナを使うために出勤したが，考えてみればインクジェット複合機くらい家にあっても良かろう。置く場所がないと思っていたが，台も一緒に買えば問題ないことに気づいてしまったので，Amazonで検索し，衝動的に注文してしまった。
• クラボウがADS Biotecと提携して研究用に販売しているイムノクロマトキットって（カタログ記載性能が二社で異なる―ADS Biotecの説明書では226例となっている―ので，別のキットである可能性もあるか？　と一瞬思ったが，Business Wireの記事ではクラボウのカタログに記載されている値が紹介されているなあ），クラボウのキットのカタログには特異度100％と書かれているのだが，本当だろうか。他のキットに比べて値が良すぎる。そこの信頼性が崩れるとこういう推論（神戸市の病院で救急部と発熱外来受診者を除いて血液検査を受けた外来受診者の血液サンプルからランダムサンプルした1000検体の検査をした結果，神戸市の有病割合3.3％ [95％CI 2.3-4.6％]と推定されたという）（リンク先はDoi A et al. "Estimation of seroprevalence of novel coronavirus disease (COVID-19) using preserved serum at an outpatient setting in Kobe, Japan: A cross-sectional study."（2020年5月1日にプレプリントサーバに掲載）を紹介しているブログ記事）の根拠が崩れてしまうので，特異度についての詳細データが欲しい。少なくとも，IgM何人，IgG何人に検査をした，ではなく，それぞれリアルタイムRT-PCR陽性の人何人，陰性の人何人に検査をしたのか公開してくれないと，特異度の信頼性がわからない（そもそも，RT-PCR陰性であっても実はSARS-CoV-2に感染している人とか，かつて無自覚に感染して治癒した人は，検査性能の評価では，SARS-CoV-2なしのグループになるはずだが，抗体検査で陽性になる可能性は高く，特異度100％という結果は原理的に怪しい）。なぜキットのカタログはクロス集計を載せていないのだろう。Doi et al.の論文は，キットの感度と特異度が十分に検証されていないことをlimitationとして触れていて，論文としてまっとうだが，仮に，特異度が実は95％でした（SARS-CoV-2に感染したことがない人でも5％は陽性と出ます，という意味），ということになると，推定される有病割合の信頼区間幅が相当に広くなってしまって，推定の意義がかなり損なわれる可能性がある。その点，解釈に注意が必要と思う。

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